序卷上全论大法第一六经正义第二合并启微第三风寒辨惑第四温暑指归第五湿异同第六平脉准绳第七卷下大阳病解第一阳明病解第二少阳病解第三太阴病解第四少阴病解第五厥阴病解第六制方大法第七
序序卷一太阳篇卷二阳明篇卷三少阳篇卷四太阴篇卷五少阴篇卷六厥阴篇
尚论篇
叙万氏幼科源流序卷之一形气发微论原病论入门审候歌观面部五脏形歌观面部五色歌三关脉纹变见歌小儿正诀指南赋胎疾脐风变蒸变蒸兼证幼疾五脏诸证肝经主病肝经兼证肝所生病急慢惊风急惊风有三因卷之二急惊风证急惊风变
卷上春温时疠湿温暑燥病寒病冬温疟疾卷下女科幼科痘科痧疹外科
序（前）弁首序凡例卷之一脉诀脉学大要脉体捷法诸脉相类止脉分人迎气口脉诀内因脉外因脉不内不外因脉死绝脉动止脉诸脉宜忌类验诸死证脉归空十法病机杂病赋病机赋病机抄略卷之二药性药性赋运气五运主病六气主病中风附
自序再自序合论诸书之得失以示初学之从违（四条）论读医书之难论诊病须知四诊论《景岳全书》论金匮肾气汤论倪涵初先生疟痢三方附录王子圣大归芍汤张洁古芍药汤附论噤口痢论吴又可《温疫论》（四条）论时邪论初诊用药
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
论治法论伤各要害处不治论用药论各穴要害之处论验轻重伤诀论用药要诀论各伤主方
导言五菜药解韭菜葱薤（蒜苗）葵藿五谷药解粳米小麦大豆黍米(又称糯小米、黄米)芝麻(又名胡麻、脂麻)五果药解杏李桃栗枣五畜药解猪肉牛肉羊肉鸡肉狗肉