叙自叙凡例医学集成卷一阴阳诸论天地阴阳人身阴阳病有阴阳药有阴阳阴虚证论阳虚证论先天解说后天解说丹田解说五行生克五脏六腑脏腑表里脏腑所属足六经辨手六经辨十二经络寸关尺解六部脉解脉定至数脉定权衡浮沉统属（
凡例卷一九恨十三不可学十传摹看手指筋纹乃医家异教说治病不可关门杀贼说治病不可开门揖盗说汤方内更换药味说看病秘诀死症辨卓溪家传口诀推拿代药赋卷二阐明五脏生克以知补母泻子辨脐风辨胎寒辨胎热辨胎毒发丹辨胎惊
简介序略言存济堂药局修合施送方并加药法
序凡例自记卷一病机赋经论总抄药性歌（凡二百四十首 添加）卷二真中风一中腑中脏类中风二气虚 附血虚。中气痰火湿痰中寒三外因内因暑证四动而得之静而得之湿证五外因内因燥证六风燥火燥虚燥火证七君火相火郁火五志
弁言序题词跋卷一卷二卷三卷四
原序上卷胎前总论恶阻胎动不安胎动腹痛胎漏下血漏胎跌扑动胎小便带血子淋子肿子满子悬子烦子嗽子疟子痫子喑外感风寒霍乱吐泻下痢热症因怒满闷小腹重坠作痛小腹虚胀闭滞胎冷腹痛欲泻胎惊心悸气促胀痛不安头眩目晕痰壅
黄帝素问灵枢叙自序卷一 刺法九针十二原一小针解二九针论三官针四终始五官能六卷二 刺法刺节真邪七逆顺八行针九血络论十论勇十一论痛十二五邪十三五乱十四五禁十五玉版十六师传十七外揣十八禁服十九卷三 经络经脉
叙卷上卷上一卷上二卷上三卷上四卷上五卷上六卷下卷下一卷下二卷下三卷下四卷下五
一百二十穴玉龙歌中风口眼斜头风偏正头风头风痰饮头项强痛牙疼乳蛾鼻渊不闻香臭眉目间痛心痛三焦上焦热痴呆赤目目病隐涩目热目烂目昏耳聋聋疠喑痰嗽喘急咳嗽腰痛伤风咳嗽鼻流清涕喘气喘哮喘痰嗽口气气满气肩肿痛肘挛
《备急千金要方》序卷一 诸论论大医习业第一论大医精诚第二论治病略例第三论诊候第四议处方第五论用药第六玉石上部玉石中部玉石下部草药上部草药中部草药下部木药上部木药中部木药下部兽上部兽中部兽下部虫鱼上部虫