《仁斋直指》序卷之一总论五脏所主论五脏病证虚实论诸阴诸阳论血营气卫论脉病逆顺论男女气血则一论问病论论《易简方论》附∶原脉论（出《保命集》）附论五篇（出《丹溪心法》）附∶十二经脉歌火湿分治论虚实分治论附
叙卷上伤寒论难读并宜补大旨三阳三阴分经名义伤寒重病多是下焦伏寒伏寒触发与伤寒时温脉证并病机异同即病伏气直中传经四证异同晚发是伤寒正病两感有三水气凌心即是三焦伤伤寒杂病皆有之无端暴喘即是寒入命门伤寒杂病
药性赋第一章 寒性药第二章 热性药第三章 温性药第四章 平性药
叙言卷一脏腑经络先后病脉证第一痉湿病脉证第二卷二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证并治第五卷三血痹虚劳病脉证并治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七卷四奔气病证治第八胸痹心痛短气病脉证
内容提要生理学合参卷一一、西医生理学脑血液皮肤消化器循环器呼吸器排泻器神经系五官器生殖器二、中医生理学五脏六腑此外病理学合参卷二一、热二、痛三、血四、呕吐五、谵语六、泻七、肿，胀八、汗九、头痛十、咳嗽
程门雪遗稿
摄生总要
上卷总论类妇人九证论难易上卷经脉类经脉之本经脉诸脏病因经不调调经论外备用方血热经早血热论外方血热经迟血寒经迟血寒论外方血虚经乱肾虚经乱经期腹痛经痛论外方崩淋经漏不止治崩淋经漏之法崩漏论外方杀血心痛热入
序题辞凡例总论第一延医法论第二表论第三里论第四寒论第五热论第六虚论第七实论第八辨惊风之误论第九不可饿论第十治痘论第十一治疹论第十二
序自叙卷一朝廷对于医者之医方卷二世界对于医者之医方卷三医者自医之医方