序序凡例卷一述原引种预防禁忌辨证卷二论治（上）卷三论治（下）卷四运气选案
十四经发挥
难经经释
简介武进阳湖合志序卷一 水部卷二 火部卷三 土部卷四 五金部卷五 石部卷六 卤石部卷七 山草部卷八 芳草部卷九 隰草部卷十 毒草部卷十一 蔓草部卷十二 水草部卷十三 石草部卷十四 谷部卷十五 菜部卷十
序卷上一、道生二、阴阳六十四卦、方圆二图三、色诊四、脉诊五、藏象卷下一、经络二、治则三、病能
前序卷上经候不调经漏不止经闭不行带下血分水分小便出血热入血室师尼寡妇寒热历节痛风（即白虎历节风）流注瘰乳痈乳岩血风疮疮阴疮（交接出血、阴挺、阴痒、阴虫附）附方并注卷下保胎小产保产子死腹中胎衣不出交骨不
序上卷本症治法兼症治法变症治法疠疡类症本症治验类症治验中卷续治诸症下卷各症方药
《滇南本草》序一《滇南本草》抄本跋《滇南本草》抄本后序重刊《滇南本草》序《滇南本草》序二第一卷石莲花木贼贯众七星草石苇白果松节、松笔头、松香、地盘松球侧柏叶玉兰花野棉花云连白芍、赤芍牡丹皮鸡头实荷叶藕
序卷上疮科总论五发痈疽论五发痈疽通治方疔疮论瘰论卷下肠痈痔论乳痈论肺痈论诸疳疮论附骨疽论诸疮论疥癣论瘿瘤论疮论便毒论
导言五菜药解韭菜葱薤（蒜苗）葵藿五谷药解粳米小麦大豆黍米(又称糯小米、黄米)芝麻(又名胡麻、脂麻)五果药解杏李桃栗枣五畜药解猪肉牛肉羊肉鸡肉狗肉